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牛流行熱
由牛流行熱病毒 (bovine ephemeral fever virus, BEFV) 病毒引起的一種發熱性急性傳染病。以高熱、呼吸困難、跛足為特徵。主要感染動物為乳牛、黃牛、水牛，偶有鹿之感染病例。所有不同品種、性別、年齡之牛隻均可能感染此病，其中以3-5歲的牛隻最易感染發病。
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惡性卡他熱
主要病原可分兩種Alcelaphine herpesvirus 1 (AlHV-1)和Ovine herpesvirus 2 (OvHV-2)，均為Gammaherpesvirinae，有封套DNA病毒，顆粒大小140~220nm。為急性、全身性的病毒性傳染病，主要發生於牛、水牛等偶蹄目及反芻動物，特徵性症狀為角膜渾濁、大量鼻分泌物、高熱、白血球減少、全身淋巴結病變、黏膜發炎至糜爛，也可在食道與氣管產生病變。可能伴隨下痢、中樞神經症狀、皮膚病變及非化膿性關節炎。除可感染許多反芻動物外，也有報告指出可感染豬。
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巴斯德桿菌症
是一種發熱性急性傳染病，以出血性敗血症與肺炎為特徵。可感染牛、羊、豬及兔子。
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弓蟲症
弓蟲的發育可以分為以下五個型態，滋養體(trophozoite)、組織囊體(tissue cyst)、裂殖體(schizont)、裂殖子(merozoite)和卵囊(oocyst)。
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牛錐蟲病
本病歷史悠久，為吸血昆蟲媒介之疾病，感染後的動物最主要之症狀為貧血、間歇熱、水腫及共濟失調。屍解並無特徵性病變，且寄生蟲血症之波動性大，故不易確診。
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黴漿菌性山羊傳染性角膜結膜炎
本病為高傳染性，造成綿羊及山羊眼睛炎症的細菌性疾病。本病原可潛伏在健康羊隻結膜，當有其它誘發因子時，造成羊隻發病。誘發因子如強光、粉塵、牧草等均可能造成眼睛的刺激，誘發疾病。傳染性角膜結膜炎會影響視力使家畜體重增重減少、產乳量下降，加上治療花費，造成農民明顯的經濟損失。
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