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牛副結核病
主要發生於牛、羊等反芻動物的慢性致死性肉芽腫性腸炎，為漸進消耗性傳染病。感染初期無臨床症狀，但可持續從糞便中排菌汙染環境；發病動物會呈現頑固性下痢和漸進性體重減輕等臨床症狀，疾病末期由於腸道大量蛋白質流失造成特徵性下頷水腫( bottle jaw)，最後因脫水和惡病質而死亡。
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假性狂犬病
此病毒對外在抵抗力強，夏天於牛舍乾草中，病毒能生存30天，冬天可存活達46天，土壤內可達3個月的存活時間。但許多消毒劑皆能使病毒失去活性。病毒由上呼吸道侵入，再進入中樞神經系統，亦可經由嗅神經、三叉神經和舌咽神經入侵延腦，病毒在上呼吸道繁殖經鼻腔及呼吸道的分泌物排出。
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Q熱
主要發生於牛、綿羊及山羊等，其他物種均可能帶原，主要造成繁殖障礙問題。病原於環境中抵抗性強，耐乾燥且於塵土中可生存數月到數年。
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牛鉤端螺旋體病
大多數的哺乳類動物皆會感染，包括野生動物，不同動物帶有不同的血清型，病原寄生於動物之腎小管，造成腎臟慢性感染，並且由尿液大量排菌並可能終生帶原。
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第四胃 (皺胃) 異位
第四胃 (皺胃) 異位 (displaced abomasum) 為乳牛消化道問題中最常見之外科疾病。依異位之位置不同，可分為左側皺胃異位 (left displaced abomasum; LDA) 及右側皺胃異位 (right displaced abomasum; RDA)。LDA 佔所有病例中的80% ~ 90%。第四胃異位好發於分娩後一個月內之高產乳牛，較少在產前三個月及分娩前發生。
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牛乳房鏈球菌性乳房炎
本病病原為革蘭氏陽性球菌，一般歸類為環境性乳房炎之病原，常造成牛隻持續性慢性感染症。本病原之抗藥性較低，一般直接以amoxicillin等一線用藥即可以治療成功，但是常因重覆感染或持續停留在乳房內造成牛隻體細胞數持續過高，而造成經濟損失。
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