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牛流行熱
由牛流行熱病毒 (bovine ephemeral fever virus, BEFV) 病毒引起的一種發熱性急性傳染病。以高熱、呼吸困難、跛足為特徵。主要感染動物為乳牛、黃牛、水牛，偶有鹿之感染病例。所有不同品種、性別、年齡之牛隻均可能感染此病，其中以3-5歲的牛隻最易感染發病。
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牛傳染性鼻氣管炎 (呼吸道型)
(1). 潛伏期：4～6日，有些達20日。(2). 臨床疾病分型最常見呼吸道型，其他型多以不同程度併發。(3). 隱性感染者為重要傳染源，其病毒潛伏於三叉神經節及腰、薦神經節中，受刺激活化後排毒於鼻汁、陰道分泌物。(4). 病程多大於10日，嚴重則數小時內死亡。
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巴斯德桿菌症
是一種發熱性急性傳染病，以出血性敗血症與肺炎為特徵。可感染牛、羊、豬及兔子。
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弓蟲症
弓蟲的發育可以分為以下五個型態，滋養體(trophozoite)、組織囊體(tissue cyst)、裂殖體(schizont)、裂殖子(merozoite)和卵囊(oocyst)。
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放線菌病
主要好發於2至5歲之牛隻，通常侵犯頷骨並造成骨髓炎、骨膜炎，並可能形成化膿性之肉芽腫。
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放線桿菌病
本病為一種會侵犯頭部與頸部皮膚與軟組織之慢性化膿性肉芽腫性疾病，典型的特徵性病變為感染舌頭組織使之變硬，因此又稱為木舌病。
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牛白血病
病牛及帶原牛為本疾病的主要傳染源。病毒主要感染B淋巴細胞，造成病毒血症。但抗體出現之後病毒會躲藏至B淋巴細胞之DNA中，導致感染牛之終身帶原。
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牛囊蟲病
無鉤絛蟲生活史之中間宿主包括：牛、綿羊、山羊以及人類，可見牛囊尾幼蟲寄生，肉眼則可見囊孢之病變；終宿主為人類，寄生於人的小腸，8週後可見成蟲。
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白肌病
本病發生之主要原因為維生素E與硒等之缺乏；其他如營養不良、環境突發劇烈改變如秋冬與強制運動也為誘因。此病大多於小牛、新生牛隻身上見到，也可能影響成年牛隻，並且常在激烈運動之後發生。
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牛焦蟲病
幼年的牛對此病的感受性低，感染後通常沒有症狀，且可以維持長時間的保護力。9 ~ 12週以上的牛隻對此病的感受性則提升。水牛和黃牛可感染但不發病。感染過的動物會成為帶原者。
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牛邊緣無形體病
成年牛隻對此病感受性較幼年牛隻高。該病原為絕對細胞內寄生，主要感染動物之紅血球，會造成紅血球脆弱而導致嚴重貧血。受感染的動物通常不示臨床症狀，但若有其他內、外因子造成緊迫等則可能發病，死亡率低，但老年牛隻 (2 ~ 3歲) 死亡率約20 ~ 50 %。耐過之動物恢復期可長達3個月，恢復後成為帶菌者，但血液中不易發現邊緣小體 (Marginal body) 的存在。
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羊齒植物中毒
地方性血尿是最常見的一種羊歯蕨類中毒的症狀。其主要的臨床症狀是間斷性血尿及貧血。在台灣，由於一年四季均可以看到羊歯蕨，所以要小心因為給予青草時，不小心割到羊歯蕨而給予餵食。在某些國家則是因季節的關係，而常在晚夏發生。
疾病的發生需要羊歯蕨的代謝與吸收，所以需要數週到數年後才會爆發。
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山羊接觸傳染性胸膜肺炎
本病傳染性可達100%及致死率60%-100%。故列為重要動物傳染病。本病可由帶原動物將病原傳播至新的未感染的地區，在密飼空間中，更容易傳播本病。肺炎及胸膜肺炎也可由其他的黴漿菌，如M. mycoides capri 傳播，則因其毒力較弱，故感染率及死亡率均較低，且會造成關節及乳房部感染。
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山羊關節炎腦炎
CAE廣泛分佈於多數工業化國家，而開發中國家的原生山羊除非曾與進口山羊接觸，否則很少出現此病。盛行率會隨年齡增加，但無關性別。多數山羊在年輕時即染病而終身帶原，並於感染後數月到數年後發病。
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