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赤羽病
為節肢動物媒介的病毒，經由吸血昆蟲傳播，如糠蠓，常造成牛、綿羊及山羊生產異常及繁殖障礙，常與死產或流產有關，，此病毒於實驗動物中，小鼠最具感受性，接種於腦內時會引起腦炎致死，但只有接種於母鼠腹腔或皮下時，始可引起流產或胎兒畸形，接種於雞胚胎卵黃囊時，會造成雞胚胎大腦發育異常或關節彎曲無法伸直等異常型態。
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彎曲桿菌症
C. jejuni為人畜共通傳染病，主要造成下痢的症狀。菌體為多型性，呈S型、弧狀、螺旋狀或逗點狀，菌體具有鞭毛，有運動性，培養時需於微好氧的環境，不同菌種生長所需的溫度不同，C. jejuni可於37-43oC生長，C. fetus需低於25oC才可生長，對環境抵抗力不強，乾燥環境、曝曬於陽光下或一般消毒劑均可殺死。
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口蹄疫
口蹄疫是由Picronaviridae科，Alphthovirus屬之口蹄疫病毒(foot-and-mouth disease virus；FMDV) 引起之高度傳染性疾病，主要對偶蹄類動物 (如：豬、鹿、牛、羊) 具感受性，疾病發生率可達100 %，除年幼動物外，否則死亡率極低。罹病之動物可見高燒，口吻、乳頭、及蹄部有水泡。
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巴斯德桿菌症
是一種發熱性急性傳染病，以出血性敗血症與肺炎為特徵。可感染牛、羊、豬及兔子。
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弓蟲症
弓蟲的發育可以分為以下五個型態，滋養體(trophozoite)、組織囊體(tissue cyst)、裂殖體(schizont)、裂殖子(merozoite)和卵囊(oocyst)。
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牛球蟲病
據文獻報導感染牛隻的球蟲有14種，其中以Eimeria zurnii、E. bovis和E.auburnensis致病力最強，又以前面二者最為常見。
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牛白血病
病牛及帶原牛為本疾病的主要傳染源。病毒主要感染B淋巴細胞，造成病毒血症。但抗體出現之後病毒會躲藏至B淋巴細胞之DNA中，導致感染牛之終身帶原。
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牛結節疹
牛結節疹有結節狀皮膚炎、潰瘍、淋巴結炎及單肢或多肢水腫等特點，發病率高但死亡率低，造成的經濟損失主要為產乳量下降、流產、不孕、牛皮無法利用等。牛結節疹最早於1929年，發生於北羅德西亞牛群，產生一種假性風疹(pseudo urticarial)，目前已存在許多非洲國家，從2000年開始於中東地區發現，而在2013年土耳其則有報告出現。
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Q熱
主要發生於牛、綿羊及山羊等，其他物種均可能帶原，主要造成繁殖障礙問題。病原於環境中抵抗性強，耐乾燥且於塵土中可生存數月到數年。
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牛囊蟲病
無鉤絛蟲生活史之中間宿主包括：牛、綿羊、山羊以及人類，可見牛囊尾幼蟲寄生，肉眼則可見囊孢之病變；終宿主為人類，寄生於人的小腸，8週後可見成蟲。
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牛鉤端螺旋體病
大多數的哺乳類動物皆會感染，包括野生動物，不同動物帶有不同的血清型，病原寄生於動物之腎小管，造成腎臟慢性感染，並且由尿液大量排菌並可能終生帶原。
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白肌病
本病發生之主要原因為維生素E與硒等之缺乏；其他如營養不良、環境突發劇烈改變如秋冬與強制運動也為誘因。此病大多於小牛、新生牛隻身上見到，也可能影響成年牛隻，並且常在激烈運動之後發生。
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淋巴肉瘤 (淋巴瘤)
淋巴肉瘤在牛身上通常以皮膚型肉瘤的型態呈現，好發於6-24月齡的牛隻，為漸進性的疾病，導致牛隻皮膚出現多發性的腫瘤，並可能伴隨淋巴相關疾病。本病可由牛白血病病毒所引起，但並非所有患牛皆與本病原有關，部分患牛體內並無此病之抗體，推測與遺傳有關，但仍需進一步的透過實驗證實。
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山羊痘
人工感染潛伏期為2至3天，自然感染為8至13天，最長可達21天。病原對酸不穩定，對乾燥有抵抗力，在污染牧場中病毒至少可存活半年之久。故根據世界動物衛生組織 (O.I.E) 的規定，養羊場對於新進羊隻的隔離檢疫至少需21天，而受感染之羊場則須經半年之後，始得復養。發病率的起伏極大，死亡率常介於10％ 至50％，所有年齡層均會受到影響，仔羊的死亡率高。死亡率高峰期為全身病變出現後2週左右。若是發生在新爆發地區死亡率可高達100%，最主要的死因通常是嚴重肺炎造成的呼吸困難。
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牛乳突狀瘤病
此病為乳突病毒 (papillomavirus) 於皮膚或黏膜所引起之良性表皮腫瘤增生，外觀常為乳突狀或多發於表面成疣狀。病灶通常不需經過處置，過一段時間就會自癒，病癒後之患牛通常會獲得一定程度之免疫能力。如牛隻身上有多量且大之疣並長時間未痊癒，此牛可能有免疫不全之問題，如牛病毒性腹瀉病毒Bovine viral diarrhea virus (BVDV) 或牛白血球吸附缺陷症Bovine Leukocyte Adhesion Deficiency (BLAD)。
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接觸傳染性化膿性口炎
接觸傳染性化膿性口炎之病原為Orf virus (OV)，呈長卵型，病毒表面具有絲狀結構排列成規則之螺旋型，大小約 160x260 nm 之具封套雙股 DNA 病毒 (圖D)。OV 親和上皮細胞。此病毒於自然環境下抵抗性強，且也能抵抗消毒劑，如乙醚及氯仿，但於 58-60℃ 加熱半小時即可破壞本病毒。感染羊隻病灶處癒合後，脫落之痂皮內仍然有高力價之病毒，能長時間存活於環境中，並感染其他羊隻。根據以上病毒特性，要於環境中徹底清除此病毒較為困難。
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