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赤羽病
為節肢動物媒介的病毒，經由吸血昆蟲傳播，如糠蠓，常造成牛、綿羊及山羊生產異常及繁殖障礙，常與死產或流產有關，，此病毒於實驗動物中，小鼠最具感受性，接種於腦內時會引起腦炎致死，但只有接種於母鼠腹腔或皮下時，始可引起流產或胎兒畸形，接種於雞胚胎卵黃囊時，會造成雞胚胎大腦發育異常或關節彎曲無法伸直等異常型態。
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藍舌病
本疾病為藉由Culicoides variipennis或Culicoides oxystoma等庫蠓傳播的病毒性傳染病，主要感染家畜和野生類動物反芻類。家畜中感受性高低依序為綿羊、牛和山羊；鹿、羚羊和巨角野羊等野生反芻動物也會感染本病，其中以鹿的感受性最高。最早在綿羊發現本病，因為它會引起舌頭發紺呈藍紫色，所以稱本疾病為藍舌病。本病於牛通常呈不顯性感染，急性病例可於蹄冠、陰道、乳頭和口腔等處之皮膚見到潰瘍，因此過去稱本病為假性口蹄疫 (Pseudo-foot and mouth disease)。
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牛流行熱
由牛流行熱病毒 (bovine ephemeral fever virus, BEFV) 病毒引起的一種發熱性急性傳染病。以高熱、呼吸困難、跛足為特徵。主要感染動物為乳牛、黃牛、水牛，偶有鹿之感染病例。所有不同品種、性別、年齡之牛隻均可能感染此病，其中以3-5歲的牛隻最易感染發病。
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口蹄疫
口蹄疫是由Picronaviridae科，Alphthovirus屬之口蹄疫病毒(foot-and-mouth disease virus；FMDV) 引起之高度傳染性疾病，主要對偶蹄類動物 (如：豬、鹿、牛、羊) 具感受性，疾病發生率可達100 %，除年幼動物外，否則死亡率極低。罹病之動物可見高燒，口吻、乳頭、及蹄部有水泡。
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假性狂犬病
此病毒對外在抵抗力強，夏天於牛舍乾草中，病毒能生存30天，冬天可存活達46天，土壤內可達3個月的存活時間。但許多消毒劑皆能使病毒失去活性。病毒由上呼吸道侵入，再進入中樞神經系統，亦可經由嗅神經、三叉神經和舌咽神經入侵延腦，病毒在上呼吸道繁殖經鼻腔及呼吸道的分泌物排出。
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沙門氏菌感染症
潛伏期：1-2 週，好發於 1-2 月齡犢牛。急性感染常見敗血症及胃腸炎；慢性感染則以肺炎及關節炎為主。
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狂犬病
為一種急性病毒性腦脊髓炎，在人畜共通傳染病裡尤為重要，所有溫血動物皆會感染，且死亡率高達100%，病毒對神經組織具有親和性，感染的動物會出現神經症狀。此病毒對於溫度、有機溶劑、酸和大多數的消毒劑皆相當敏感，於室溫時，數日之內會失去活性。
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牛海綿狀腦病
其病原不屬於細菌也不屬於病毒，屬於一種缺之核酸之醣蛋白 (prion)。Prion位於神經細胞表面，是一種醣蛋白，以glycophosphatidyl與細胞膜連結，正常的prion是α-helices結構 (cellular prion protein; PrPC)，變性後的prion會轉變為β-sheets結構 (scrapie prion protein; PrPSc)。PrPSc會將神經細胞內正常的PrPC轉化成PrPSc，並以等比級數的速度累積在神經細胞內，終使腦組織變成海綿樣。
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牛白血病
病牛及帶原牛為本疾病的主要傳染源。病毒主要感染B淋巴細胞，造成病毒血症。但抗體出現之後病毒會躲藏至B淋巴細胞之DNA中，導致感染牛之終身帶原。
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牛結節疹
牛結節疹有結節狀皮膚炎、潰瘍、淋巴結炎及單肢或多肢水腫等特點，發病率高但死亡率低，造成的經濟損失主要為產乳量下降、流產、不孕、牛皮無法利用等。牛結節疹最早於1929年，發生於北羅德西亞牛群，產生一種假性風疹(pseudo urticarial)，目前已存在許多非洲國家，從2000年開始於中東地區發現，而在2013年土耳其則有報告出現。
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壞死桿菌病
壞死桿菌廣泛分布於環境中如土壤、糞便等，在牛隻口腔、腸道中也可分離出本菌。本病好發於體表如皮膚組織與消化道，也可能轉移至內臟。臨床上於成牛會轉變為腐蹄病，而於小牛則轉變為壞死性口炎，俗稱白喉。
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乳酸中毒症
當動物食入過多的穀類(在台灣以玉米為主)時，會造成瘤胃細菌(尤其是Streptococcus bovis)過量生長，經由代謝而產生過多之乳酸，使瘤胃之pH值小於5，而使得其中之原蟲及其他需求中性環境之細菌死亡。在此環境中，乳酸菌又過度生長，產生更多的乳酸，因滲透壓之改變，造成水份向瘤胃集中，而使動物脫水。
乳酸經由血液吸收後，由於肝臟無法及時處理而造成血液中堆積過多乳酸，產生乳酸酸血症，造成血液濃縮(hemoconcentration)，心循環系統衰弱 (cardiovascular collapse)、腎衰竭，肌肉衰弱、休克最後死亡。未死亡的動物常在數週後有瘤胃內黴素增生 (mycotic rumenitis)，及肝膿腫的情形出現。
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妊娠毒血症
本病為營養性疾病，常發生在懷孕的末期，尤其是懷有雙胞胎或以上胎兒時。又稱為酮病 (ketosis)，常發生在分娩前2-4週，有時也可發生在泌乳期。羊隻因營養成份之醣類缺乏，血糖下降，造成動物轉而代謝體內之脂肪，造成血中酮體 (ketone)量的上升，導致本病的產生。
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山羊關節炎腦炎
CAE廣泛分佈於多數工業化國家，而開發中國家的原生山羊除非曾與進口山羊接觸，否則很少出現此病。盛行率會隨年齡增加，但無關性別。多數山羊在年輕時即染病而終身帶原，並於感染後數月到數年後發病。
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