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藍舌病
本疾病為藉由Culicoides variipennis或Culicoides oxystoma等庫蠓傳播的病毒性傳染病，主要感染家畜和野生類動物反芻類。家畜中感受性高低依序為綿羊、牛和山羊；鹿、羚羊和巨角野羊等野生反芻動物也會感染本病，其中以鹿的感受性最高。最早在綿羊發現本病，因為它會引起舌頭發紺呈藍紫色，所以稱本疾病為藍舌病。本病於牛通常呈不顯性感染，急性病例可於蹄冠、陰道、乳頭和口腔等處之皮膚見到潰瘍，因此過去稱本病為假性口蹄疫 (Pseudo-foot and mouth disease)。
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牛流行熱
由牛流行熱病毒 (bovine ephemeral fever virus, BEFV) 病毒引起的一種發熱性急性傳染病。以高熱、呼吸困難、跛足為特徵。主要感染動物為乳牛、黃牛、水牛，偶有鹿之感染病例。所有不同品種、性別、年齡之牛隻均可能感染此病，其中以3-5歲的牛隻最易感染發病。
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布氏桿菌病
牛布氏桿菌症之特徵為生殖器官及胎膜發炎，引起流產、不育以及各種組織之局部病灶。
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牛副結核病
主要發生於牛、羊等反芻動物的慢性致死性肉芽腫性腸炎，為漸進消耗性傳染病。感染初期無臨床症狀，但可持續從糞便中排菌汙染環境；發病動物會呈現頑固性下痢和漸進性體重減輕等臨床症狀，疾病末期由於腸道大量蛋白質流失造成特徵性下頷水腫( bottle jaw)，最後因脫水和惡病質而死亡。
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惡性卡他熱
主要病原可分兩種Alcelaphine herpesvirus 1 (AlHV-1)和Ovine herpesvirus 2 (OvHV-2)，均為Gammaherpesvirinae，有封套DNA病毒，顆粒大小140~220nm。為急性、全身性的病毒性傳染病，主要發生於牛、水牛等偶蹄目及反芻動物，特徵性症狀為角膜渾濁、大量鼻分泌物、高熱、白血球減少、全身淋巴結病變、黏膜發炎至糜爛，也可在食道與氣管產生病變。可能伴隨下痢、中樞神經症狀、皮膚病變及非化膿性關節炎。除可感染許多反芻動物外，也有報告指出可感染豬。
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巴斯德桿菌症
是一種發熱性急性傳染病，以出血性敗血症與肺炎為特徵。可感染牛、羊、豬及兔子。
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放線菌病
主要好發於2至5歲之牛隻，通常侵犯頷骨並造成骨髓炎、骨膜炎，並可能形成化膿性之肉芽腫。
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放線桿菌病
本病為一種會侵犯頭部與頸部皮膚與軟組織之慢性化膿性肉芽腫性疾病，典型的特徵性病變為感染舌頭組織使之變硬，因此又稱為木舌病。
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氣腫疽(梭菌性肌炎，黑腿病)
為一種地方流行性且快速傳播之傳染病，通常會快速發病、高燒、患部肌肉腫脹且擠壓時有聲音，由於患處會有氣體且潰爛因此又稱為黑腿病。
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牛白血病
病牛及帶原牛為本疾病的主要傳染源。病毒主要感染B淋巴細胞，造成病毒血症。但抗體出現之後病毒會躲藏至B淋巴細胞之DNA中，導致感染牛之終身帶原。
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白肌病
本病發生之主要原因為維生素E與硒等之缺乏；其他如營養不良、環境突發劇烈改變如秋冬與強制運動也為誘因。此病大多於小牛、新生牛隻身上見到，也可能影響成年牛隻，並且常在激烈運動之後發生。
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淋巴肉瘤 (淋巴瘤)
淋巴肉瘤在牛身上通常以皮膚型肉瘤的型態呈現，好發於6-24月齡的牛隻，為漸進性的疾病，導致牛隻皮膚出現多發性的腫瘤，並可能伴隨淋巴相關疾病。本病可由牛白血病病毒所引起，但並非所有患牛皆與本病原有關，部分患牛體內並無此病之抗體，推測與遺傳有關，但仍需進一步的透過實驗證實。
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牛乳突狀瘤病
此病為乳突病毒 (papillomavirus) 於皮膚或黏膜所引起之良性表皮腫瘤增生，外觀常為乳突狀或多發於表面成疣狀。病灶通常不需經過處置，過一段時間就會自癒，病癒後之患牛通常會獲得一定程度之免疫能力。如牛隻身上有多量且大之疣並長時間未痊癒，此牛可能有免疫不全之問題，如牛病毒性腹瀉病毒Bovine viral diarrhea virus (BVDV) 或牛白血球吸附缺陷症Bovine Leukocyte Adhesion Deficiency (BLAD)。
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小反芻獸疫
本病毒為一具有封套 (envelope) 之單股核醣核酸 (RNA) 病毒，其分類主要是基於其融合蛋白基因（Fusion protein gene, F），可知共有四族系（lineage），族系1及2僅於西非可見。而族系3在東非可見，族系4則在中東及亞洲可見，而族系4與族系1相似。病原主要感染綿羊及山羊，但也會感染其他野生動物，如紅鹿 (Cervus elaphus)、白尾鹿 (Odocoileus virginianus)、瞪羚 (Gazelle)、阿爾卑斯野山羊(ibex) 及野生綿羊。
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山羊接觸傳染性胸膜肺炎
本病傳染性可達100%及致死率60%-100%。故列為重要動物傳染病。本病可由帶原動物將病原傳播至新的未感染的地區，在密飼空間中，更容易傳播本病。肺炎及胸膜肺炎也可由其他的黴漿菌，如M. mycoides capri 傳播，則因其毒力較弱，故感染率及死亡率均較低，且會造成關節及乳房部感染。
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