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氣腫疽(梭菌性肌炎，黑腿病)
為一種地方流行性且快速傳播之傳染病，通常會快速發病、高燒、患部肌肉腫脹且擠壓時有聲音，由於患處會有氣體且潰爛因此又稱為黑腿病。
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白肌病
本病發生之主要原因為維生素E與硒等之缺乏；其他如營養不良、環境突發劇烈改變如秋冬與強制運動也為誘因。此病大多於小牛、新生牛隻身上見到，也可能影響成年牛隻，並且常在激烈運動之後發生。
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牛焦蟲病
幼年的牛對此病的感受性低，感染後通常沒有症狀，且可以維持長時間的保護力。9 ~ 12週以上的牛隻對此病的感受性則提升。水牛和黃牛可感染但不發病。感染過的動物會成為帶原者。
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牛錐蟲病
本病歷史悠久，為吸血昆蟲媒介之疾病，感染後的動物最主要之症狀為貧血、間歇熱、水腫及共濟失調。屍解並無特徵性病變，且寄生蟲血症之波動性大，故不易確診。
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牛邊緣無形體病
成年牛隻對此病感受性較幼年牛隻高。該病原為絕對細胞內寄生，主要感染動物之紅血球，會造成紅血球脆弱而導致嚴重貧血。受感染的動物通常不示臨床症狀，但若有其他內、外因子造成緊迫等則可能發病，死亡率低，但老年牛隻 (2 ~ 3歲) 死亡率約20 ~ 50 %。耐過之動物恢復期可長達3個月，恢復後成為帶菌者，但血液中不易發現邊緣小體 (Marginal body) 的存在。
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第四胃 (皺胃) 異位
第四胃 (皺胃) 異位 (displaced abomasum) 為乳牛消化道問題中最常見之外科疾病。依異位之位置不同，可分為左側皺胃異位 (left displaced abomasum; LDA) 及右側皺胃異位 (right displaced abomasum; RDA)。LDA 佔所有病例中的80% ~ 90%。第四胃異位好發於分娩後一個月內之高產乳牛，較少在產前三個月及分娩前發生。
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羊搔癢症
羊搔癢症是傳染性海綿狀腦病（Transmissible spongiform encephalopathy; TSE）的一種，由普利昂蛋白感染所致，造成宿主中樞神經系統的細胞膜上蓄積了許多異常之醣蛋白（Scrapie Prion Protein; PrPSc）， 形成腦部的退化性疾病。罹病動物產生劇癢、共濟失調、衰弱及死亡。主要感染的動物是綿羊及山羊，目前未有報告會感染人類。此外，病原還有抗熱、抗化學藥物及抗輻射等特性。
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羊齒植物中毒
地方性血尿是最常見的一種羊歯蕨類中毒的症狀。其主要的臨床症狀是間斷性血尿及貧血。在台灣，由於一年四季均可以看到羊歯蕨，所以要小心因為給予青草時，不小心割到羊歯蕨而給予餵食。在某些國家則是因季節的關係，而常在晚夏發生。
疾病的發生需要羊歯蕨的代謝與吸收，所以需要數週到數年後才會爆發。
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乳酸中毒症
當動物食入過多的穀類(在台灣以玉米為主)時，會造成瘤胃細菌(尤其是Streptococcus bovis)過量生長，經由代謝而產生過多之乳酸，使瘤胃之pH值小於5，而使得其中之原蟲及其他需求中性環境之細菌死亡。在此環境中，乳酸菌又過度生長，產生更多的乳酸，因滲透壓之改變，造成水份向瘤胃集中，而使動物脫水。
乳酸經由血液吸收後，由於肝臟無法及時處理而造成血液中堆積過多乳酸，產生乳酸酸血症，造成血液濃縮(hemoconcentration)，心循環系統衰弱 (cardiovascular collapse)、腎衰竭，肌肉衰弱、休克最後死亡。未死亡的動物常在數週後有瘤胃內黴素增生 (mycotic rumenitis)，及肝膿腫的情形出現。
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牛隻低血鈣症
本病為急性到亞急性，因低血鈣症造成四肢發抖及震顫。於任何時期產生低血鈣的問題，造成牛或羊隻起立不能。由於本病常發生在高產乳牛或生犢之後，故稱為乳熱。本病亦可在分娩前數日發生。因牛與羊之低血鈣症略有不同，故在此，僅敘述牛之低血鈣症。
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