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赤羽病
為節肢動物媒介的病毒，經由吸血昆蟲傳播，如糠蠓，常造成牛、綿羊及山羊生產異常及繁殖障礙，常與死產或流產有關，，此病毒於實驗動物中，小鼠最具感受性，接種於腦內時會引起腦炎致死，但只有接種於母鼠腹腔或皮下時，始可引起流產或胎兒畸形，接種於雞胚胎卵黃囊時，會造成雞胚胎大腦發育異常或關節彎曲無法伸直等異常型態。
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藍舌病
本疾病為藉由Culicoides variipennis或Culicoides oxystoma等庫蠓傳播的病毒性傳染病，主要感染家畜和野生類動物反芻類。家畜中感受性高低依序為綿羊、牛和山羊；鹿、羚羊和巨角野羊等野生反芻動物也會感染本病，其中以鹿的感受性最高。最早在綿羊發現本病，因為它會引起舌頭發紺呈藍紫色，所以稱本疾病為藍舌病。本病於牛通常呈不顯性感染，急性病例可於蹄冠、陰道、乳頭和口腔等處之皮膚見到潰瘍，因此過去稱本病為假性口蹄疫 (Pseudo-foot and mouth disease)。
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牛流行熱
由牛流行熱病毒 (bovine ephemeral fever virus, BEFV) 病毒引起的一種發熱性急性傳染病。以高熱、呼吸困難、跛足為特徵。主要感染動物為乳牛、黃牛、水牛，偶有鹿之感染病例。所有不同品種、性別、年齡之牛隻均可能感染此病，其中以3-5歲的牛隻最易感染發病。
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布氏桿菌病
牛布氏桿菌症之特徵為生殖器官及胎膜發炎，引起流產、不育以及各種組織之局部病灶。
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牛副結核病
主要發生於牛、羊等反芻動物的慢性致死性肉芽腫性腸炎，為漸進消耗性傳染病。感染初期無臨床症狀，但可持續從糞便中排菌汙染環境；發病動物會呈現頑固性下痢和漸進性體重減輕等臨床症狀，疾病末期由於腸道大量蛋白質流失造成特徵性下頷水腫( bottle jaw)，最後因脫水和惡病質而死亡。
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彎曲桿菌症
C. jejuni為人畜共通傳染病，主要造成下痢的症狀。菌體為多型性，呈S型、弧狀、螺旋狀或逗點狀，菌體具有鞭毛，有運動性，培養時需於微好氧的環境，不同菌種生長所需的溫度不同，C. jejuni可於37-43oC生長，C. fetus需低於25oC才可生長，對環境抵抗力不強，乾燥環境、曝曬於陽光下或一般消毒劑均可殺死。
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牛傳染性鼻氣管炎 (呼吸道型)
(1). 潛伏期：4～6日，有些達20日。(2). 臨床疾病分型最常見呼吸道型，其他型多以不同程度併發。(3). 隱性感染者為重要傳染源，其病毒潛伏於三叉神經節及腰、薦神經節中，受刺激活化後排毒於鼻汁、陰道分泌物。(4). 病程多大於10日，嚴重則數小時內死亡。
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假性狂犬病
此病毒對外在抵抗力強，夏天於牛舍乾草中，病毒能生存30天，冬天可存活達46天，土壤內可達3個月的存活時間。但許多消毒劑皆能使病毒失去活性。病毒由上呼吸道侵入，再進入中樞神經系統，亦可經由嗅神經、三叉神經和舌咽神經入侵延腦，病毒在上呼吸道繁殖經鼻腔及呼吸道的分泌物排出。
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子宮蓄膿
子宮蓄膿是指牛隻子宮內存有膿汁，通常因為異常分娩、子宮感染發生，直腸檢查時可發現卵巢有黃體存在，子宮膨大沈於腹腔下方，子宮內有波動感但完全無收縮性，壓迫子宮有時會有膿汁排出。子宮蓄膿症很少有全身的症狀出現，可由胎衣滯留、交配感染或子宮炎轉化而來。如果是在配種後發生的，大多與早期胚胎死亡有關，應當懷疑牛隻患有造成胎兒死亡的疾病，像是滴蟲症。如果是在分娩後發生的，則可懷疑是否有胎衣滯留、異常分娩造成子宮復舊延緩。
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弓蟲症
弓蟲的發育可以分為以下五個型態，滋養體(trophozoite)、組織囊體(tissue cyst)、裂殖體(schizont)、裂殖子(merozoite)和卵囊(oocyst)。
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牛病毒性下痢
牛病毒性下痢為由黃病毒科 (Flaviridae) 之瘟疫病毒屬 (Pestivirus) 所引起之傳染病。此病造成動物長期帶原與免疫抑制，且導致懷孕母牛流死產與受胎率下降、公牛精液異常以及小牛生長緩慢，並造成經濟上損失。症狀於嚴重之黏膜病可見整段消化道黏膜之充血、出血、糜爛及潰瘍之情形。
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牛結節疹
牛結節疹有結節狀皮膚炎、潰瘍、淋巴結炎及單肢或多肢水腫等特點，發病率高但死亡率低，造成的經濟損失主要為產乳量下降、流產、不孕、牛皮無法利用等。牛結節疹最早於1929年，發生於北羅德西亞牛群，產生一種假性風疹(pseudo urticarial)，目前已存在許多非洲國家，從2000年開始於中東地區發現，而在2013年土耳其則有報告出現。
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Q熱
主要發生於牛、綿羊及山羊等，其他物種均可能帶原，主要造成繁殖障礙問題。病原於環境中抵抗性強，耐乾燥且於塵土中可生存數月到數年。
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牛鉤端螺旋體病
大多數的哺乳類動物皆會感染，包括野生動物，不同動物帶有不同的血清型，病原寄生於動物之腎小管，造成腎臟慢性感染，並且由尿液大量排菌並可能終生帶原。
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陰道脫垂
多發生於懷孕後期，由於固定陰道之組織及陰道本身鬆弛，與某些原因所造成之腹壓上升而引發。
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牛滴蟲病
T. foetus主要感染牛的生殖系統。在公牛感染不顯示臨床症狀，也不影響其生殖性能或精液品質，但能成為帶菌者經由交配過程傳染給母牛。但因T. foetus對乾燥及高溫敏感，故無法在環境中長期生存。
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李斯特菌病
單核細菌增生性李斯特菌，又名李斯特菌。是一種兼性厭氧、型小、有移動性、革蘭氏陽性、非孢子形成，有強烈抗環境性，雙極染色性之球桿菌。可以在4-44 °C中生存。病原主要是生長在有植物的土壤中，有大於42種動物及22種鳥類、魚、昆蟲及其他許多環境中均能生存。李斯特菌主要生長在土壤中及哺乳動物的胃腸道中，因此，二者均非常容易造成植物(蔬菜類)中含有本菌而造成人因食入而造成感染。本病原不喜在酸性環境中生長。
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山羊關節炎腦炎
CAE廣泛分佈於多數工業化國家，而開發中國家的原生山羊除非曾與進口山羊接觸，否則很少出現此病。盛行率會隨年齡增加，但無關性別。多數山羊在年輕時即染病而終身帶原，並於感染後數月到數年後發病。
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