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赤羽病
為節肢動物媒介的病毒，經由吸血昆蟲傳播，如糠蠓，常造成牛、綿羊及山羊生產異常及繁殖障礙，常與死產或流產有關，，此病毒於實驗動物中，小鼠最具感受性，接種於腦內時會引起腦炎致死，但只有接種於母鼠腹腔或皮下時，始可引起流產或胎兒畸形，接種於雞胚胎卵黃囊時，會造成雞胚胎大腦發育異常或關節彎曲無法伸直等異常型態。
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藍舌病
本疾病為藉由Culicoides variipennis或Culicoides oxystoma等庫蠓傳播的病毒性傳染病，主要感染家畜和野生類動物反芻類。家畜中感受性高低依序為綿羊、牛和山羊；鹿、羚羊和巨角野羊等野生反芻動物也會感染本病，其中以鹿的感受性最高。最早在綿羊發現本病，因為它會引起舌頭發紺呈藍紫色，所以稱本疾病為藍舌病。本病於牛通常呈不顯性感染，急性病例可於蹄冠、陰道、乳頭和口腔等處之皮膚見到潰瘍，因此過去稱本病為假性口蹄疫 (Pseudo-foot and mouth disease)。
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牛流行熱
由牛流行熱病毒 (bovine ephemeral fever virus, BEFV) 病毒引起的一種發熱性急性傳染病。以高熱、呼吸困難、跛足為特徵。主要感染動物為乳牛、黃牛、水牛，偶有鹿之感染病例。所有不同品種、性別、年齡之牛隻均可能感染此病，其中以3-5歲的牛隻最易感染發病。
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彎曲桿菌症
C. jejuni為人畜共通傳染病，主要造成下痢的症狀。菌體為多型性，呈S型、弧狀、螺旋狀或逗點狀，菌體具有鞭毛，有運動性，培養時需於微好氧的環境，不同菌種生長所需的溫度不同，C. jejuni可於37-43oC生長，C. fetus需低於25oC才可生長，對環境抵抗力不強，乾燥環境、曝曬於陽光下或一般消毒劑均可殺死。
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牛傳染性鼻氣管炎 (呼吸道型)
(1). 潛伏期：4～6日，有些達20日。(2). 臨床疾病分型最常見呼吸道型，其他型多以不同程度併發。(3). 隱性感染者為重要傳染源，其病毒潛伏於三叉神經節及腰、薦神經節中，受刺激活化後排毒於鼻汁、陰道分泌物。(4). 病程多大於10日，嚴重則數小時內死亡。
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巴斯德桿菌症
是一種發熱性急性傳染病，以出血性敗血症與肺炎為特徵。可感染牛、羊、豬及兔子。
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假性狂犬病
此病毒對外在抵抗力強，夏天於牛舍乾草中，病毒能生存30天，冬天可存活達46天，土壤內可達3個月的存活時間。但許多消毒劑皆能使病毒失去活性。病毒由上呼吸道侵入，再進入中樞神經系統，亦可經由嗅神經、三叉神經和舌咽神經入侵延腦，病毒在上呼吸道繁殖經鼻腔及呼吸道的分泌物排出。
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沙門氏菌感染症
潛伏期：1-2 週，好發於 1-2 月齡犢牛。急性感染常見敗血症及胃腸炎；慢性感染則以肺炎及關節炎為主。
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弓蟲症
弓蟲的發育可以分為以下五個型態，滋養體(trophozoite)、組織囊體(tissue cyst)、裂殖體(schizont)、裂殖子(merozoite)和卵囊(oocyst)。
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牛球蟲病
據文獻報導感染牛隻的球蟲有14種，其中以Eimeria zurnii、E. bovis和E.auburnensis致病力最強，又以前面二者最為常見。
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氣腫疽(梭菌性肌炎，黑腿病)
為一種地方流行性且快速傳播之傳染病，通常會快速發病、高燒、患部肌肉腫脹且擠壓時有聲音，由於患處會有氣體且潰爛因此又稱為黑腿病。
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狂犬病
為一種急性病毒性腦脊髓炎，在人畜共通傳染病裡尤為重要，所有溫血動物皆會感染，且死亡率高達100%，病毒對神經組織具有親和性，感染的動物會出現神經症狀。此病毒對於溫度、有機溶劑、酸和大多數的消毒劑皆相當敏感，於室溫時，數日之內會失去活性。
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牛病毒性下痢
牛病毒性下痢為由黃病毒科 (Flaviridae) 之瘟疫病毒屬 (Pestivirus) 所引起之傳染病。此病造成動物長期帶原與免疫抑制，且導致懷孕母牛流死產與受胎率下降、公牛精液異常以及小牛生長緩慢，並造成經濟上損失。症狀於嚴重之黏膜病可見整段消化道黏膜之充血、出血、糜爛及潰瘍之情形。
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犢牛隱孢子蟲感染症
本疾病之病原為 Cryptosporidium muris，主要發生在5-28日齡之犢牛，有時亦可見於約1月齡之犢牛，腸道為其主要的寄生部位，嚴重時整個消化道都可能被其寄生。隱孢子蟲感染正可以經糞口途徑或受污染的飼料與水源等來傳播，隱孢子蟲的卵囊在被牛隻食入後，會在體內釋出子孢子，子孢子對所有消化道皆具有親和力，其中又以迴腸黏膜和小腸腸細孢為最強。子孢子會在會在細孢的表面形成空泡，空泡破掉以後會是出裂殖子，進而感染其它腸細孢，造成大量的腸細孢被破壞。寄生在腸道的隱孢子蟲有20 %是薄壁卵囊，另外的80 %是厚壁卵囊，前者可以留在體內形成持續性的感染，後者則是會隨著糞便排出體外。
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牛結節疹
牛結節疹有結節狀皮膚炎、潰瘍、淋巴結炎及單肢或多肢水腫等特點，發病率高但死亡率低，造成的經濟損失主要為產乳量下降、流產、不孕、牛皮無法利用等。牛結節疹最早於1929年，發生於北羅德西亞牛群，產生一種假性風疹(pseudo urticarial)，目前已存在許多非洲國家，從2000年開始於中東地區發現，而在2013年土耳其則有報告出現。
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Q熱
主要發生於牛、綿羊及山羊等，其他物種均可能帶原，主要造成繁殖障礙問題。病原於環境中抵抗性強，耐乾燥且於塵土中可生存數月到數年。
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壞死桿菌病
壞死桿菌廣泛分布於環境中如土壤、糞便等，在牛隻口腔、腸道中也可分離出本菌。本病好發於體表如皮膚組織與消化道，也可能轉移至內臟。臨床上於成牛會轉變為腐蹄病，而於小牛則轉變為壞死性口炎，俗稱白喉。
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白肌病
本病發生之主要原因為維生素E與硒等之缺乏；其他如營養不良、環境突發劇烈改變如秋冬與強制運動也為誘因。此病大多於小牛、新生牛隻身上見到，也可能影響成年牛隻，並且常在激烈運動之後發生。
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陰道脫垂
多發生於懷孕後期，由於固定陰道之組織及陰道本身鬆弛，與某些原因所造成之腹壓上升而引發。
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淋巴肉瘤 (淋巴瘤)
淋巴肉瘤在牛身上通常以皮膚型肉瘤的型態呈現，好發於6-24月齡的牛隻，為漸進性的疾病，導致牛隻皮膚出現多發性的腫瘤，並可能伴隨淋巴相關疾病。本病可由牛白血病病毒所引起，但並非所有患牛皆與本病原有關，部分患牛體內並無此病之抗體，推測與遺傳有關，但仍需進一步的透過實驗證實。
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